Przejdź do treści
Księgowość dla branży medycznej

Księgowość dla lekarzy i branży medycznej — kontrakt B2B, zwolnienie z VAT, ryczałt

Lekarz, pielęgniarka, fizjoterapeuta czy ratownik na kontrakcie ma kilka spraw, których nie ma typowa JDG: zwolnienie z VAT zależy od celu usługi, gabinet lekarski z pacjentami prywatnymi potrzebuje kasy online od pierwszej wizyty, a dla usług opieki zdrowotnej stawka ryczałtu wynosi 14%. Prowadzimy księgowość takich działalności od 200 zł netto miesięcznie, po ukraińsku, rosyjsku i polsku, w całej Polsce online.

Od 200 zł netto / mies.Cała Polska onlinePo ukraińsku i rosyjskuPomoc w założeniu JDG 0 zł
Zapytaj o wycenę

Czym różni się księgowość w branży medycznej

Sama działalność jest zwykłą JDG — różnią się sytuacje, które w medycynie zdarzają się prawie zawsze. Kontrakt ze szpitalem zamiast etatu, dyżury w kilku miejscach, pacjenci prywatni w gabinecie, czasem opinia dla sądu albo orzeczenie dla ubezpieczyciela.

Każda z tych rzeczy ma swoje zasady w podatkach i w VAT. Kiedy księgowa zna je z góry, faktura dla szpitala ma właściwą podstawę zwolnienia, a przychody zwolnione i opodatkowane nie mieszają się w jednej ewidencji.

Typowe sytuacje w medycynie i co robimy

Najczęstsze przypadki u lekarzy, pielęgniarek, fizjoterapeutów i ratowników medycznych.

SytuacjaCo to oznaczaCo robimy
Kontrakt ze szpitalem lub przychodniąUsługi opieki medycznej są zwolnione z VAT (art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o VAT) — także wtedy, gdy płaci szpital, a nie pacjentSprawdzamy podstawę zwolnienia na fakturach i prowadzimy ewidencję
Pacjenci prywatni w gabinecie lekarskimLekarz i lekarz dentysta rejestrują sprzedaż dla osób prywatnych na kasie online od pierwszej usługi, bez względu na obroty (§ 4 rozporządzenia MF z 17 grudnia 2024 r.)Ujmujemy raporty z kasy w ewidencji
Opinia dla sądu, orzeczenie dla ubezpieczycielaNie służy leczeniu ani profilaktyce, więc co do zasady nie korzysta ze zwolnienia z art. 43 ustawy o VATRozdzielamy przychody zwolnione i opodatkowane, pilnujemy obowiązków w VAT
Kontrakt u byłego pracodawcy, np. po rezydenturzeJeśli usługi są takie same jak praca na etacie w tym lub poprzednim roku, ryczałt nie przysługuje (art. 8 ust. 2 ustawy o ryczałcie)Sprawdzamy zakres umowy jeszcze przed pierwszą fakturą
Pielęgniarka, fizjoterapeuta, ratownik na kontrakcieUsługi z działu 86 PKWiU — ryczałt 14%; zajęcia poprawiające kondycję poza tym działem mają inną stawkęUstalamy stawkę według faktycznie świadczonych usług

Stan prawny na 5 października 2026 r. Jak to wygląda w Twojej działalności, zależy od formy opodatkowania i rodzaju usług.

Zwolnienie z VAT: decyduje cel usługi

Usługi opieki medycznej, które służą profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia, są zwolnione z VAT. Przepis (art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o podatku od towarów i usług) obejmuje m.in. lekarzy, lekarzy dentystów, pielęgniarki, położne i inne zawody medyczne.

Sam zawód nie wystarcza. Opinia dla sądu albo prokuratury czy orzeczenie o uszczerbku na zdrowiu dla ubezpieczyciela nie służą leczeniu, dlatego co do zasady nie są zwolnione — tak wynika z orzecznictwa TSUE i interpretacji organów. Takie przychody ewidencjonujemy osobno od pierwszej faktury.

Co obejmuje obsługa

W ramach miesięcznej opłaty:

  • prowadzenie ewidencji przychodów (ryczałt) albo KPiR;
  • deklaracje do urzędu skarbowego i pilnowanie terminów ZUS;
  • rozdzielanie przychodów zwolnionych z VAT i opodatkowanych;
  • ujmowanie raportów z kasy fiskalnej w ewidencji;
  • dostęp do programu do wystawiania faktur;
  • stała księgowa, która zna Twoją działalność i odpowiada po ukraińsku, rosyjsku lub polsku.

Dokumenty z kilku kontraktów i dyżurów przesyłasz elektronicznie, w jednym miejscu.

Ile to kosztuje

Cena zależy od liczby dokumentów w miesiącu i od tego, czy jesteś czynnym podatnikiem VAT. Lekarz na jednym-dwóch kontraktach zwykle mieści się w pierwszym progu.

Dokumentów w miesiącuBez VATZ VAT
do 5200 zł netto250 zł netto
do 15280 zł netto350 zł netto
do 25340 zł netto390 zł netto

Dokument to np. faktura, transakcja bankowa albo raport z kasy. Pomoc w założeniu JDG — 0 zł przy umowie na obsługę na min. 12 miesięcy. Pełny cennik →

Jak zaczynamy współpracę

  1. Rozmowa

    Mówisz, gdzie pracujesz, na ilu kontraktach i czy przyjmujesz pacjentów prywatnie. Od razu mówimy, czego potrzebujesz — np. czy wymagana jest kasa online.

  2. Umowa i dostęp

    Umowę podpisujesz online profilem zaufanym, dostajesz dostęp do programu do faktur i kontakt do swojej księgowej.

  3. Start działalności

    Jeśli trzeba — pomagamy założyć JDG i sprawdzamy zakres kontraktu, zanim wystawisz pierwszą fakturę dla szpitala.

  4. Comiesięczne rozliczenia

    Przesyłasz dokumenty elektronicznie, my liczymy podatek i ZUS i przypominamy o terminach.

Zapytaj o wycenę

Napisz, gdzie pracujesz (szpital, przychodnia, własny gabinet), na ilu kontraktach i czy masz już firmę. Odpowiemy z ceną i listą tego, co trzeba zrobić na start.

Nie chcesz wypełniać formularza? Napisz do nas — odpowiemy w tym samym miejscu.

Pytania o księgowość w branży medycznej

Jaka stawka ryczałtu dotyczy lekarza?+

Dla usług w zakresie opieki zdrowotnej (dział 86 PKWiU) — 14% (art. 12 ust. 1 pkt 2a lit. a ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym). Ta sama stawka dotyczy pielęgniarek, położnych, fizjoterapeutów i ratowników medycznych, jeśli ich usługi mieszczą się w tym dziale. Stawkę ustalamy według usług, które faktycznie świadczysz.

Mam kontrakt ze szpitalem. Czy wystawiam fakturę z VAT?+

Usługi opieki medycznej są zwolnione z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o VAT — także wtedy, gdy płaci szpital, a nie pacjent. Na fakturze podaje się podstawę zwolnienia. Jeśli kontrakt obejmuje też czynności, które nie służą leczeniu, rozliczamy je osobno.

Czy lekarz musi mieć kasę fiskalną?+

Tak, jeśli przyjmuje pacjentów prywatnych. Lekarze i lekarze dentyści rejestrują sprzedaż dla osób prywatnych na kasie online od pierwszej usługi, bez względu na obroty (§ 4 rozporządzenia MF z 17 grudnia 2024 r.). Przy fakturach wyłącznie dla szpitala czy przychodni kasa nie jest potrzebna.

Ile kosztuje księgowość dla lekarza?+

Od 200 zł netto miesięcznie przy działalności bez VAT i do 5 dokumentów w miesiącu; z VAT — od 250 zł netto. Lekarz na jednym-dwóch kontraktach zwykle mieści się w tym progu.

Jestem z Ukrainy. Czy mogę założyć JDG bez karty pobytu?+

Tak, jeśli masz PESEL ze statusem UKR — ochrona czasowa pozwala prowadzić JDG do 4 marca 2027 r. Pomoc w założeniu JDG kosztuje 0 zł przy umowie na obsługę na min. 12 miesięcy.

Muszę przychodzić do biura?+

Nie. Pracujemy online z klientami z całej Polski — dokumenty przesyłasz elektronicznie, umowę podpisujesz zdalnie profilem zaufanym. Biuro mamy w Rzeszowie, jeśli wolisz spotkać się na miejscu.

W jakim języku się kontaktujemy?+

Po ukraińsku, rosyjsku albo polsku — jak Ci wygodniej. Twoja księgowa odpowiada w tym samym języku.

Wycena jest bezpłatna

Napisz, jak pracujesz — powiemy, ile będzie kosztować obsługa i co trzeba załatwić na start.

Informacje zweryfikowane: 5 października 2026 r. Źródła:Ustawa o zryczałtowanym podatku dochodowym — art. 8 i art. 12 (stawki ryczałtu) · Ustawa o podatku od towarów i usług — art. 43 (zwolnienia) · Rozporządzenie Ministra Finansów z 17 grudnia 2024 r. w sprawie zwolnień z obowiązku prowadzenia ewidencji sprzedaży przy zastosowaniu kas rejestrujących

Autor merytoryczny: Liliia Konoplyova, członek zarządu Gryphon Group (Executive MBA, CAP). Poznaj eksperta →

Co dalej — powiązane strony

WhatsAppTelegram